2019-11-19から1日間の記事一覧

Bashスクリプト

概要 Bashスクリプト作成の時にいつも調べてしまうのでまとめておく。 環境 macOS Mojave 10.14.5 変数の扱い a='aaa' echo ${a} 計算の仕方 two=$((3-1)) echo $(two) if bashの比較演算子は文字列と数値とで大きく異なる 文字列比較 =で比較する a='aaa' i…

Amberで力場パラメータを作成する

概要 リガンド-タンパク質の複合体の力場パラメータ(拡張子が.prmtop 、.inpcrd)を作成する。 環境 AmberTools19 タンパク質の準備 タンパク質についてはパラメータを作成する前にいくつか注意点がある 解像度は十分高いか 欠損残基はあるか:キャップを形…