2019-11-18から1日間の記事一覧

Ridge回帰の実装

概要 実装はsklearnを利用する。 環境 sklearn 0.21.2 matplotlib 3.1.1 実装 データ ボストンデータを利用する。 from sklearn.datasets import load_boston from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.preprocessing import Stan…

VMDで水素結合を解析する (GUI, CUI)

VMD

概要 vmdで水素結合の解析をする。GUIとCUIでの方法を紹介する。 環境 macOS Mojave 10.14.5 vmd 1.9.3 GUIでの方法 まずは構造ファイルとトラジェクトリ ファイルを読み込む。読み込み方はこちら → VMDの使い方の基本 (Mac) 水素結合の数をプロット VMD Mai…